中科院古脊椎所张弛副研究员应邀做客BSEE生态与进化论坛
BSEE生态与进化论坛第六讲:张弛博士“Bayesian Total-Evidence Dating”
2020年12月3日,中科院古脊椎所张弛副研究员应邀做客BSEE生态与进化论坛,做了《Bayesian Total-Evidence Dating》的专题讲座,由白伟宁教授主持。
张驰研究员的研究方向包含计算演化生物学。通过建立统计模型,发展新算法,运用计算机模拟,分析基因组数据及形态性状数据,探索一些重要演化生物学问题的解决方案,例如系统发生关系重建、物种界定、分化时间估计、重要演化事件推断等。
本次论坛张弛老师介绍了整合化石与现生类群的形态与分子数据进行系统发育关系重建与分化时间估计方法的最新进展。首先张老师从已灭绝生物的数据(化石)、现存物种数据进行联合统计推断(Joint inference)介绍了贝叶斯模型的数据集构成,并讨论不同数据的特点。接着从分子数据和形态学数据两个方面详细地介绍了建立贝叶斯模型的过程,包括似然值计算、贝叶斯法以及蒙特卡罗-马尔可夫链的基本原理,以及模型中参数与矩阵的含义及设置方法,并结合实例做了进一步探讨。
报告结束,大家纷纷针对自己感兴趣的问题向张弛老师请教,张老师也一一作了耐心的回答。BSEE生态与进化论坛第六讲顺利结束。